一般来说，高三的停课手续最迟要在第一学期末办理。高三下学期原则上不得停课。具体时间规定以当地教育部门和学校制定的《在校学生管理规定》为准。
高中休学详细流程
因病不能继续学习的，须持有县级以上医院的疾病诊断证明。学生或者家长应当提出书面申请，经学校同意，并报教育行政部门备案，方可办理休学手续。
如有其他特殊情况，学生或家长须提出书面申请并提供相关证明材料。经学校同意并报教育行政部门备案后，方可办理休学手续。
患有严重传染病的学生应停学。
如果学生缺席超过一个学期的三分之一，应被告知停课。
学生还有一年的剩余学期。学生在休学期间应保留学籍。期满后学生如需复学，由学生本人或家长提出申请。因病休学的，还应当持有县级以上医院开具的证明，经学校批准方可复学，并报教育行政部门备案。
停牌相关规定
1.本科生学籍管理规定见《学生手册》。
2.学生有下列情形之一的，应当休学：
A 因伤病经医院诊断需要停课治疗和休息的学生占学期总学时的1/3以上。
B 根据出勤情况，一个学期累计因病缺课超过该学期总课时的1/3。
C因特殊疾病，学校认为有必要休学。
D 在允许的学习时间内，学生的休学期一般为一年。特殊情况下，经学校批准可适当延长，但总计不得超过两年。
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